最近发生一连串音乐家遭到杀害的事件，而所有被害者生前都曾在某个知名钢琴家所举办的音乐学校上过课。某日，柯南一行人受邀前往参加这位钢琴家所兴建的音乐厅之落成纪念音乐会，在这场世界著名音乐家云集的音乐会中，最受瞩目的主角是一名天才女歌手，没想到却传出有人企图暗杀这名女歌手的消息；虽然柯南在千钧一发之际出手相救，让她得以躲过杀手的暗杀，但犯人并未就此放弃，反而将欲杀害的目标转移到柯南等人身上。犯人的魔掌不断朝着柯南等人伸出，他这么做的目的，难道是想要阻挠这场音乐会吗？ 音乐会当天，柯南在进入会场之前遭到某人袭击而失去了意识，但小兰等人却完全不知道这件事，仍继续朝着会场走去。不久，这场音乐会终于开始了…… 突然间，外面的大厅发生大爆炸，使得周围陷入了一片火海。不过，由于音乐厅内部并没有受损，而且是在完全的隔音状态下，因此场内的观众完全没有察觉到爆炸的发生，音乐会也就继续进行着。即使如此，音乐厅外部的爆炸仍持续不断发生，包含小兰、灰原与少年探侦团等1000名以上的观众，就这样不知不觉中被困在音乐厅内部而成为人质。 此时，小兰察觉到了一件事。她发现现场演奏的旋律，是她和新一就读国中时曾经听过的旋律。这首曲子是否就是破解事件真相的关键？ 柯南在醒来后，也随即赶去寻找小兰。柯南能否顺利解救小兰等人脱困？而在这道旋律的背后，又到底隐藏着什么样的真相呢？