尼奥(基努·里维斯KeanuReeves饰)和崔妮蒂(凯瑞-安·莫斯Carrie-AnneMoss饰)重回矩阵:在这里,一个是矩阵创造出来,周而复始的日常世界,另一个则是隐藏其后,真实的人类世界。为了弄清楚自己所处的“现实”究竟是真是假,尼奥不得不再次做出选择