大雄一行人在空地上聆听着出木杉叙述小说《金银岛》的情节，而大雄却睡着了，并梦见自己成为海盗。在地震的摇晃后，大雄从梦中醒来，并扬言去寻找真正的金银岛，不料却遭到胖虎和小夫的嘲笑。「我一定会找到金银岛！」大雄这样对胖虎声明，并答应如果失败了，就用鼻子吃卡邦尼意粉。大雄知道自己夸下海口，便向哆啦A梦求救，之后使用道具「寻宝地图」寻找金银岛。然而地图指示出来的位置，居然是太平洋上莫名冒出来的新岛屿......。大雄一行人乘搭名为「大雄奥拉号」的船前往金银岛，就在即将靠岸时，一群海盗突然来袭。面对突然现身的敌人，大雄与他们陷入一阵苦战。不久后，金银岛竟然沉入海底，而静香亦突然被抓到海盗船上一同沉入海底。海盗们逃走后，大雄他们遇到一名在海上漂流的少年「弗洛克」和一只名叫「谜题」的机械鹦鹉。弗洛克自称是从海盗船逃出来的机械工，并且知道金银岛隐藏的重要秘密，原来那座岛是一艘高速运行的海盗船，用23世纪的高科技制成，一边穿梭于过去、现在、未来，一边攫取沉睡在海底的宝藏。大雄一行人决心要救出静香，而弗洛克亦担忧此时正在海盗船上的妹妹「莎菈」。与此同时，海盗船正在高速运行，而静香则被带到一个房间，并遇见莎菈，静香发现二人长相一模一样，只是头发颜色不同。在这种特别的缘份下，二人成了好朋友。莎菈更帮助静香隐藏身分，以免被其他海盗发现。静香在莎菈的帮助下，到岛上的食堂工作。在厨房里，静香发现法式土司在这家餐厅非常有人气，莎菈透露这是她的母亲教她做的，是餐厅的招牌菜。但当静香问及莎菈母亲现时的状况时，莎菈则说她的母亲费欧娜已在5年前（实际是2254年）过世，静香连声道歉。莎菈接着说她的母亲是一名伟大的科学家，尽管工作很忙，但是一回家，就会给她和哥哥做法式土司。静香从中得知莎菈的哥哥（弗洛克）离开了海盗船，被问及原因，莎菈则说她的哥哥一直和父亲合不来，总想着有一天一定要离开这里。静香从莎菈哥哥的意气用事联想到大雄在空地曾信誓旦旦许下「用鼻子吃卡邦尼意粉」的诺言，认为大雄逞这种威风实在是没意义，并将此事告诉莎菈，二人同时哈哈大笑，令双方友情更加深厚...